Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3V0E1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3V0E1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms