Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9Q3V038 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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