Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms