Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BB287469Q3UT53 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BB287469Q3UT53 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms