Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms