Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc33Q3ULW6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms