Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms