Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms