Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf224Q3UIW8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf224Q3UIW8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf224Q3UIW8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf224Q3UIW8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf224Q3UIW8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf224Q3UIW8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf224Q3UIW8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf224Q3UIW8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf224Q3UIW8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf224Q3UIW8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf224Q3UIW8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms