Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf2Q3UAW9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms