Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U6N9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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