Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hvcn1Q3U2S8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms