Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorlQ3U285 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms