Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms