Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alkbh5Q3TSG4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Alkbh5Q3TSG4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Alkbh5Q3TSG4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alkbh5Q3TSG4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms