Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms