Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TQQ9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TQQ9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms