Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9Z9

Zufsp, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZufspQ3T9Z9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZufspQ3T9Z9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms