Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms