Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms