Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc1Q0VDN7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc1Q0VDN7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms