Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam83bQ0VBM2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam83bQ0VBM2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms