Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5cQ0V8T7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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