Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cib3Q0P523 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms