Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms