Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms