Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col9a2Q07643 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms