Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfe2Q07279 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms