Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms