Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr5Q04683 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr5Q04683 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms