Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VcpQ01853 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VcpQ01853 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms