Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec23aQ01405 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms