Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cds1P98191 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms