Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlkP97793 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AlkP97793 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AlkP97793 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AlkP97793 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AlkP97793 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AlkP97793 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AlkP97793 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AlkP97793 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AlkP97793 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlkP97793 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AlkP97793 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlkP97793 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AlkP97793 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms