Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cry1P97784 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms