Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas2P97460 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas2P97460 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas2P97460 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas2P97460 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas2P97460 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas2P97460 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas2P97460 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas2P97460 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas2P97460 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas2P97460 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas2P97460 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas2P97460 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms