Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhodP97348 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RhodP97348 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RhodP97348 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RhodP97348 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RhodP97348 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RhodP97348 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RhodP97348 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RhodP97348 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhodP97348 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhodP97348 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhodP97348 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhodP97348 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms