Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr1bP70700 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms