Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx3P70354 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Msx3P70354 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms