Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig1P70193 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms