Protein–RNA interactions for Protein: P70166

Cpeb1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb1P70166 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpeb1P70166 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpeb1P70166 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb1P70166 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms