Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrb3P63080 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms