Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms