Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2lP62876 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2lP62876 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms