Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps4xP62702 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps4xP62702 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms