Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms