Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms