Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abce1P61222 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms