Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms