Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms